16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_03630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415883  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 
301 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  41.37 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8230  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 
274 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5769  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6771  flavin reductase-like, FMN-binding  35.14 
 
 
221 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1644  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826883  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0206  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>