81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8230 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8230  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
274 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  41.87 
 
 
301 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.72 
 
 
284 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415883  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 
295 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5769  alpha/beta hydrolase fold protein  42.23 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6771  flavin reductase-like, FMN-binding  38.43 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1644  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826883  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.19 
 
 
301 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  22.39 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 
396 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.89 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.89 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.22 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.31 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.6 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.6 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.2 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  23.72 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.32 
 
 
251 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.49 
 
 
270 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.49 
 
 
270 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
245 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.87 
 
 
270 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.91 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.1 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  31.66 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  26.35 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  21.37 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
280 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.8 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.2 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0206  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.2 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  22.86 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  21.11 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.95 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.39 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  22.8 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  22.8 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 
270 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>