91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0319 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  88.81 
 
 
301 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5769  alpha/beta hydrolase fold protein  51.21 
 
 
248 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.37 
 
 
284 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415883  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8230  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 
274 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6771  flavin reductase-like, FMN-binding  39.92 
 
 
221 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1644  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826883  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0206  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.31 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  31.23 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  36.09 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  36.09 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  36.09 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  29.67 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.09 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1122  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.48 
 
 
269 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.93 
 
 
265 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  32.37 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  37.89 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.21 
 
 
425 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  24.89 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  34.15 
 
 
269 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
261 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
277 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
287 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1351  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
263 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.32 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  31.03 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.86 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.62 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.39 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
266 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.43 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
350 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
261 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
288 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.73 
 
 
266 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>