90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4764 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4913  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4863  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.676773  normal  0.639801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4764  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4911  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125309  normal  0.115148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  45.86 
 
 
161 aa  137  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  45.86 
 
 
161 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  45.86 
 
 
161 aa  137  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  45.86 
 
 
161 aa  137  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  45.22 
 
 
161 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  39.01 
 
 
165 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  39.01 
 
 
165 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  36.17 
 
 
165 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  36.17 
 
 
165 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  28.77 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  28.46 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  28.46 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  26.92 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  27.69 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  26.92 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  26.92 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  26.92 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  27.61 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  33.83 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.15 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  27.34 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  28.46 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  29.03 
 
 
163 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.39 
 
 
167 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.92 
 
 
161 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.78 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.71 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  28.99 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  37.38 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  25.19 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.69 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  26.92 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  26.15 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.15 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  26.92 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  26.92 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  28.03 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.17 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.71 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  25.58 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  26.72 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  26.15 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.82 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.53 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  26.12 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  29.52 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  26.53 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.46 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  27.42 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.43 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  27.91 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  27.13 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  29.69 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  29.13 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  26.32 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1534  hypothetical protein  24.44 
 
 
224 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.282463  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  26.55 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  26.55 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  29.71 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.46 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.55 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  25.36 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  30.23 
 
 
181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  28.33 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  30.36 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  30.21 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  25.36 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.68 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>