77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4911 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4911  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  307  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125309  normal  0.115148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4913  hypothetical protein  99.32 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4863  putative cytoplasmic protein  99.32 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.676773  normal  0.639801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4764  putative cytoplasmic protein  99.32 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  99.32 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  45.22 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  45.22 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  45.22 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  45.22 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  44.59 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  39.58 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  38.3 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  35.46 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  35.46 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  28.08 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  27.69 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  27.69 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  26.92 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  26.15 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  26.15 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  26.15 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  26.15 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  27.69 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  26.87 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  33.08 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  25.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.38 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  27.69 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.74 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  25.95 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.06 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.15 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.99 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  28.26 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.53 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  36.45 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  26.15 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  26.12 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  25.38 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  26.15 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.46 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.38 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.92 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  26.15 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  27.91 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.99 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  25.95 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.23 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  25.38 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  24.81 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.45 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.46 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.13 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  26.61 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.68 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  28.91 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  26.36 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>