119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2431 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2431  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  57.95 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  57.95 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  57.95 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  57.95 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  57.95 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  52.04 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  53.93 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  47.78 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  48.19 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6917  SAF domain protein  46.99 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0349459  normal  0.284569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  48.57 
 
 		 496 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  43.24 
 
 		 496 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  39.56 
 
 		 512 aa  68.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  44.16 
 
 		 495 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  42.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  44.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  44.59 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  42.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  42.67 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  42.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  42.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  42.31 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  42.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  44.29 
 
 		 496 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  42.11 
 
 		 511 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  44.16 
 
 		 514 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  44.21 
 
 		 533 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  41.56 
 
 		 495 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  41.56 
 
 		 495 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  41.56 
 
 		 495 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  44.16 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  42.31 
 
 		 508 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  44.16 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  34.57 
 
 		 493 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  45.45 
 
 		 523 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  40.26 
 
 		 495 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  38.96 
 
 		 498 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  38.64 
 
 		 519 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  37.35 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  32.56 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  41.43 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  44 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  37.21 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  43.59 
 
 		 507 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  40.23 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  42.5 
 
 		 501 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  38.24 
 
 		 507 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  38.24 
 
 		 507 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  38.78 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  41.03 
 
 		 500 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  41.03 
 
 		 500 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  36.71 
 
 		 513 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  36.71 
 
 		 513 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  39.74 
 
 		 507 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  41.03 
 
 		 500 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  38.46 
 
 		 500 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  32.22 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  42.31 
 
 		 509 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  34.21 
 
 		 496 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  34.21 
 
 		 496 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  34.21 
 
 		 496 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  36.84 
 
 		 512 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 507 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  40.23 
 
 		 515 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  40.24 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  27.16 
 
 		 496 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  37.18 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  40 
 
 		 513 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  38.89 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  34.48 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  35.9 
 
 		 507 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  30.69 
 
 		 523 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  45.21 
 
 		 508 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  37.18 
 
 		 500 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  40 
 
 		 509 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  37.97 
 
 		 508 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  36.84 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  33.71 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  39.44 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  42.31 
 
 		 507 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  30.12 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  36.59 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  35.44 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  41.25 
 
 		 507 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  31.4 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  32.67 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  32.93 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  35.21 
 
 		 509 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  39.73 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  36.36 
 
 		 525 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  32.61 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  40.43 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  30.88 
 
 		 540 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  33.96 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  35.8 
 
 		 510 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  30 
 
 		 582 aa  43.9  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  32.1 
 
 		 551 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  32.47 
 
 		 550 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>