138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2155 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  75.53 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  75.53 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  67.02 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  56.52 
 
 		 93 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  54.35 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  55.56 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  61.7 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  61.96 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  54.44 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  59.78 
 
 		 93 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  52.22 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  50 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  48.35 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  42.55 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  41.49 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  37.23 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  40 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  41.11 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  35.96 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  42.47 
 
 		 533 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  39.56 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  28.89 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  39.22 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  47.17 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  30.56 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  36 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  34.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  34.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  34.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  34.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  36.59 
 
 		 495 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  36.59 
 
 		 495 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  36.59 
 
 		 495 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  42.31 
 
 		 512 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  35.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  35.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  35.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  35.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  35.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  37.7 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  45.83 
 
 		 514 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  46.81 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  35.37 
 
 		 495 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  36.92 
 
 		 509 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  33.33 
 
 		 500 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 500 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  40 
 
 		 519 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  40 
 
 		 508 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  44.9 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  48.84 
 
 		 513 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  33.71 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  33.71 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 496 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  39.68 
 
 		 505 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  46.51 
 
 		 508 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  39.39 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 500 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  40 
 
 		 501 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  37.25 
 
 		 525 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  34.38 
 
 		 523 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  46.51 
 
 		 515 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  44 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  35.53 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  44.44 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  38.55 
 
 		 511 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  39.62 
 
 		 496 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  45.65 
 
 		 507 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  35.29 
 
 		 512 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  42.86 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  40.79 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  48.84 
 
 		 508 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  44.19 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  42 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  51.16 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  51.16 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  43.48 
 
 		 507 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  36.54 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  47.73 
 
 		 510 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  40.82 
 
 		 513 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  31.43 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  39.62 
 
 		 496 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  46.51 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  34.44 
 
 		 564 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  33.33 
 
 		 509 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  35 
 
 		 495 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  42.22 
 
 		 507 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  48.84 
 
 		 507 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  40 
 
 		 510 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  43.14 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2431  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  33.96 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  45 
 
 		 500 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  36 
 
 		 509 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>