161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2463 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  77.67 
 
 		 107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  46.88 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  48.39 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  47.25 
 
 		 95 aa  94.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  46.32 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  45.74 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  47.19 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  45.92 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  41.49 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  41.11 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  41.38 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  43.82 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.43 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.43 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  39.33 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  42.39 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  41.38 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  41.38 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  42.39 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  42.39 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  43.55 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  42.39 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  42.39 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  38.46 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 512 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  34.83 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  45.45 
 
 		 525 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  40.32 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  35.87 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  39.51 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  37.97 
 
 		 512 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  50 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  40.26 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  50 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  40.51 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  40.51 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  40.51 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  40.51 
 
 		 495 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  45.57 
 
 		 514 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  41.56 
 
 		 533 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  39.24 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  39.24 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  37.14 
 
 		 500 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  39.24 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  36.59 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  37.14 
 
 		 500 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  39.24 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  39.24 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  42.86 
 
 		 508 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  38.27 
 
 		 507 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  37.14 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  39.53 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  34.57 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  37.66 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  37.11 
 
 		 498 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  35.44 
 
 		 496 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  30.39 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  41.56 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  34.18 
 
 		 513 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  43.4 
 
 		 505 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.77 
 
 		 501 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.95 
 
 		 523 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  37.04 
 
 		 495 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  33.77 
 
 		 508 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  32.94 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  47.06 
 
 		 534 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  37.08 
 
 		 503 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  37.18 
 
 		 523 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 500 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  32.56 
 
 		 508 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  38.27 
 
 		 514 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  36.36 
 
 		 509 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  35.44 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  38.27 
 
 		 514 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  41.67 
 
 		 533 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  41.67 
 
 		 564 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  34.48 
 
 		 509 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  34.52 
 
 		 511 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  34.02 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  39.58 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  32.1 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  39.58 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  30.77 
 
 		 551 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1138  galactarate dehydratase  36.59 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  36 
 
 		 523 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3856  D-galactarate dehydratase  28.26 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  35.06 
 
 		 513 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  35.44 
 
 		 540 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  36 
 
 		 523 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  35.06 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  35.44 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  34.18 
 
 		 496 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>