161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3705 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  82.86 
 
 		 105 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  66.3 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  49.45 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  52.22 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  56.04 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  47.78 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  47.25 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  53.85 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  53.85 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  45.16 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  47.25 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  50 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  45.56 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  46.67 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  50.56 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  47.19 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  52.75 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  56.92 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  40.86 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  50.55 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  44.71 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  50 
 
 		 495 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  50 
 
 		 495 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  50 
 
 		 495 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  48.78 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  48.78 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  48.78 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  47.5 
 
 		 496 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  48.78 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  48.78 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  47.78 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  48.78 
 
 		 495 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  37.78 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  38.82 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  42.05 
 
 		 526 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  35.16 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  63.04 
 
 		 510 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 500 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  38.1 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  38.1 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  38.1 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  39.29 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  38.1 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  42.7 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  60.47 
 
 		 507 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  60.47 
 
 		 507 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  48.15 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  43.9 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  42.17 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  43.37 
 
 		 514 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  35.96 
 
 		 500 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  35.96 
 
 		 500 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  43.59 
 
 		 500 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  41.18 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  41.18 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  41.18 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  41.18 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  58.14 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  44.71 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  42.31 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  46.15 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  43.59 
 
 		 507 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  42.35 
 
 		 496 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  37.08 
 
 		 498 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  43.04 
 
 		 508 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  39.74 
 
 		 525 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  54.35 
 
 		 503 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  44.87 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  37.8 
 
 		 496 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  41.25 
 
 		 493 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  37.8 
 
 		 496 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  37.8 
 
 		 496 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  36.47 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  37.65 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  54 
 
 		 511 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  38.71 
 
 		 513 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  42.68 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  39.51 
 
 		 512 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  41.98 
 
 		 533 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  34.88 
 
 		 519 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 500 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  32.5 
 
 		 512 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  45.1 
 
 		 507 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  40.23 
 
 		 514 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  34.78 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.08 
 
 		 501 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  37.04 
 
 		 496 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  37.04 
 
 		 496 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  36.71 
 
 		 505 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  42.5 
 
 		 514 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  42.5 
 
 		 514 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  36.36 
 
 		 513 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6917  SAF domain protein  34.78 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0349459  normal  0.284569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  35.96 
 
 		 523 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  39.51 
 
 		 496 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  36.36 
 
 		 513 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  35.87 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  36.67 
 
 		 530 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>