56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3856 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3856  D-galactarate dehydratase  100 
 
 		 111 aa  219  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  37.36 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  33.73 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  37.78 
 
 		 495 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  37.78 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  37.78 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 496 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 496 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  30.77 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  36.14 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  38.3 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  36.26 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  35.56 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  35.56 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  35.56 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  36.67 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  35.56 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  35.56 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  36.67 
 
 		 495 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  29.03 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  37.36 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  33.02 
 
 		 496 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  33.33 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  35.11 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  33.33 
 
 		 496 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  32.56 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  31.91 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  28.26 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  31.4 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 511 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  39.39 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  32.22 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  32.53 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  32.22 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  32.22 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  32.22 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  32.22 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  31.52 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  29.21 
 
 		 493 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  37.35 
 
 		 514 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  37.35 
 
 		 514 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  31.4 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  35.56 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  33.73 
 
 		 514 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  38.89 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  36.73 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  25.88 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  29.41 
 
 		 518 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  33.67 
 
 		 505 aa  41.2  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  31.88 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  30.12 
 
 		 512 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  27.59 
 
 		 498 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  30 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>