156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0766 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  100 
 
 
96 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  98.96 
 
 
96 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  98.96 
 
 
96 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  98.96 
 
 
96 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  98.96 
 
 
96 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  50.53 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  51.65 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  50 
 
 
106 aa  92  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  49.45 
 
 
96 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  45.05 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  41.67 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  42.39 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  43.18 
 
 
512 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  42.39 
 
 
500 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  42.39 
 
 
500 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  38.04 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  41.3 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  42.7 
 
 
533 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  45.68 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  38.2 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  37.36 
 
 
505 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  37.93 
 
 
500 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  40.48 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  40.45 
 
 
508 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  37.23 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  35.63 
 
 
500 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  39.13 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  40.48 
 
 
503 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  38.37 
 
 
508 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  39.29 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  35.96 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.85 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  36.56 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.85 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  36.47 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.80997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  38.04 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  41.56 
 
 
533 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  38.55 
 
 
495 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  38.55 
 
 
495 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  38.55 
 
 
495 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  39.51 
 
 
507 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  37.65 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  32.56 
 
 
496 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  38.55 
 
 
495 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  38.1 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  38.1 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  38.1 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  38.1 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  38.1 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  37.5 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  37.35 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  37.35 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  37.35 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  37.35 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  37.35 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  41.38 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  41.67 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  34.44 
 
 
517 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  40.74 
 
 
508 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  35.8 
 
 
514 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  37.21 
 
 
496 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  36.59 
 
 
519 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  38.67 
 
 
525 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  36.17 
 
 
498 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  37.04 
 
 
514 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  37.04 
 
 
514 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  39.66 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  48.94 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  34.88 
 
 
496 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  37.21 
 
 
496 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  45.45 
 
 
107 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  36.14 
 
 
495 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  37.21 
 
 
496 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  36.71 
 
 
513 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  39.24 
 
 
509 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  39.51 
 
 
523 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  33.33 
 
 
92 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  33.72 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  37.8 
 
 
523 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  37.8 
 
 
523 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  37.8 
 
 
523 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  37.8 
 
 
523 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  36.26 
 
 
508 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  37.5 
 
 
509 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  40.82 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  36.59 
 
 
511 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  35.44 
 
 
507 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  35.8 
 
 
507 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  36.9 
 
 
523 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  36.67 
 
 
540 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  35.8 
 
 
507 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  36.59 
 
 
513 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  34.57 
 
 
510 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  29.55 
 
 
512 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  33.33 
 
 
550 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  36.59 
 
 
513 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  34.83 
 
 
501 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  43.14 
 
 
513 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>