164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5297 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  100 
 
 		 96 aa  196  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  80 
 
 		 96 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  58.7 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  51.65 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  51.65 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  51.65 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  51.65 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  51.65 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  45.98 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  42.39 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  42.71 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  41.41 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  39.33 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  47.5 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  38.04 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  40.45 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  48.75 
 
 		 533 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  38.3 
 
 		 517 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  38.37 
 
 		 496 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  43.75 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  34.07 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  36.96 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  40 
 
 		 500 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  40 
 
 		 500 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  35.16 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  41.25 
 
 		 514 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  38.04 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  43.37 
 
 		 510 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  34.83 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  40.23 
 
 		 507 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  42.5 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  38.37 
 
 		 503 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  39 
 
 		 500 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  37.23 
 
 		 508 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  35.71 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  35.71 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  39.29 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  38.1 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  38.1 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  38.71 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  41.25 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  30.56 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  38.75 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  41.38 
 
 		 505 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  48.98 
 
 		 525 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  38.71 
 
 		 523 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  43.21 
 
 		 519 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  41.94 
 
 		 516 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  33.7 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  32.94 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  35.71 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  38.75 
 
 		 500 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  35.71 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  35.71 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  35.71 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  34.44 
 
 		 508 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  38.46 
 
 		 513 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  36.11 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6917  SAF domain protein  36.36 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0349459  normal  0.284569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  36.25 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 511 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  34.41 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  34.41 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  34.41 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  39.76 
 
 		 526 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  34.72 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  35.37 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3856  D-galactarate dehydratase  38.46 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  34.92 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  37.18 
 
 		 513 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  37.35 
 
 		 507 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  36.25 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  36.25 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  34.88 
 
 		 530 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  37.7 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  41.77 
 
 		 510 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  43.14 
 
 		 509 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  36.25 
 
 		 507 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  40.74 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  46.94 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  32.63 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  36.59 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  37.35 
 
 		 515 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  35.87 
 
 		 508 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  36.27 
 
 		 500 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  37.08 
 
 		 501 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  38.89 
 
 		 508 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  36.25 
 
 		 507 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  35.42 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  33.33 
 
 		 518 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  40.7 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>