104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0125 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  100 
 
 
96 aa  189  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  36.96 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  36.67 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  41.57 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  38.04 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  37.36 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  32.97 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  39.29 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  41.18 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  41.57 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  36.73 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  39.77 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  36.36 
 
 
496 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  35.16 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  35.42 
 
 
508 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  35.16 
 
 
498 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3856  D-galactarate dehydratase  37.36 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  40.48 
 
 
523 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  36.59 
 
 
510 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  31.52 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  34.44 
 
 
540 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  34.83 
 
 
508 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  38.46 
 
 
514 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  35.11 
 
 
98 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  34.07 
 
 
509 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  40.48 
 
 
523 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  30.34 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  35.79 
 
 
501 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  35.96 
 
 
514 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  37.18 
 
 
512 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  35.37 
 
 
514 aa  48.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  32.84 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  35.37 
 
 
514 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  37.93 
 
 
523 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  31.52 
 
 
493 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  34.09 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  32.26 
 
 
500 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.83 
 
 
505 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  39.02 
 
 
513 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  34.83 
 
 
511 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  34.07 
 
 
533 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  32.84 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  30.34 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  36.14 
 
 
538 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  37.04 
 
 
507 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  38.1 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  38.1 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  35.71 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  38.1 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  35.71 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  35.71 
 
 
495 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  31.71 
 
 
508 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  38.1 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  39.58 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  38.1 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  29.67 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  43.75 
 
 
503 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  29.67 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  29.67 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  29.67 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  33.87 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  37.08 
 
 
519 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  34.09 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  32.93 
 
 
508 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  29.76 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  32.94 
 
 
507 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  32.14 
 
 
495 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  35.71 
 
 
495 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  30.23 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2961  putative hydrolase  30.23 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663883  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  35.71 
 
 
518 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  33.33 
 
 
507 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  33.87 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  32.93 
 
 
500 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  32.93 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  32.93 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  39.22 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  34.48 
 
 
507 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  32.14 
 
 
517 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  44.9 
 
 
525 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  32.91 
 
 
551 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  28.12 
 
 
496 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  32.18 
 
 
515 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6917  SAF domain protein  31.4 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0349459  normal  0.284569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  32.93 
 
 
500 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  28.41 
 
 
496 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  30.34 
 
 
533 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  29.41 
 
 
508 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  36.14 
 
 
508 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  35.16 
 
 
507 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  36 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  32.58 
 
 
513 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  32.93 
 
 
507 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>