191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1141 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  67.02 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  56.38 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  54.95 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  51.65 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  50.54 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  51.65 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  49.46 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  50 
 
 		 105 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  45.92 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  40.43 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  43.01 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  48.81 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  43.62 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  38 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  48.05 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  49.38 
 
 		 523 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  48.05 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  42.55 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  41.41 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  47.78 
 
 		 496 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  45.45 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  46.67 
 
 		 503 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  47.95 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  47.95 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  46.25 
 
 		 495 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  46.25 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  41.67 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  39.78 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  46.25 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  46.15 
 
 		 533 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  45 
 
 		 495 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  45 
 
 		 495 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  45 
 
 		 495 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  45 
 
 		 495 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  45 
 
 		 495 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  39.13 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  44.3 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  55.56 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  38.71 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  51.28 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  43.68 
 
 		 523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  45 
 
 		 495 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  45.57 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  46.84 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  44.3 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  43.68 
 
 		 523 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  59.62 
 
 		 514 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  61.22 
 
 		 507 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  46.43 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  38.89 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  40.96 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  59.62 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  42.5 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  40.22 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  60.78 
 
 		 508 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  59.62 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  59.18 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  41.98 
 
 		 512 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  40 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  44.3 
 
 		 509 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  56.25 
 
 		 510 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  43.75 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  40.96 
 
 		 500 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  40.51 
 
 		 525 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  45.57 
 
 		 501 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  41.18 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  43.04 
 
 		 508 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  41.57 
 
 		 505 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  38.27 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  59.18 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  45.57 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  37.65 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  37.08 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  37.65 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 500 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  39.76 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  40.96 
 
 		 508 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  39.76 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  41.77 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  40.45 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  62.79 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  37.65 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  39.02 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  36.47 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  37.65 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  37.35 
 
 		 512 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  41.46 
 
 		 519 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  42.86 
 
 		 507 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  41.03 
 
 		 507 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  37.5 
 
 		 508 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  58.14 
 
 		 509 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  62.79 
 
 		 508 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  38.75 
 
 		 496 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  38.75 
 
 		 496 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  42.05 
 
 		 508 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  38.75 
 
 		 496 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  41.11 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>