133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4419 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  100 
 
 
98 aa  197  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  73.47 
 
 
98 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  46.88 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  47.25 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  50 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  40.62 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  51.65 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.80997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  47.83 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  44.44 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  48.89 
 
 
92 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  45.56 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  44.44 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  42.7 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  41.49 
 
 
496 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  42.68 
 
 
514 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  46.51 
 
 
498 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  41.11 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  40 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  41.11 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  37.23 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  37.23 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  37.23 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  37.23 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  37.23 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  39.76 
 
 
510 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  36.36 
 
 
493 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  35.63 
 
 
500 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  36.36 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  35.63 
 
 
500 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  35.63 
 
 
500 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.86 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.86 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  35.48 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  37.35 
 
 
495 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  36.9 
 
 
512 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  34.88 
 
 
512 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  53.06 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  36.59 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2431  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  32.56 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  33.71 
 
 
500 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  36.67 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  40.23 
 
 
507 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  48.15 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  48.21 
 
 
505 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  33.71 
 
 
501 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  40.74 
 
 
495 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  40.74 
 
 
495 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  40.74 
 
 
495 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  36.26 
 
 
503 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  38.55 
 
 
514 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  38.55 
 
 
514 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  28.4 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  45.83 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  39.76 
 
 
523 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  39.51 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  40.74 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  34.83 
 
 
507 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  32.58 
 
 
500 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  39.51 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  40.74 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  39.51 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  39.51 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  39.51 
 
 
495 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.36 
 
 
517 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  33.72 
 
 
500 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  35.37 
 
 
510 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  38.46 
 
 
533 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  38.89 
 
 
513 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  35.11 
 
 
96 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  38.96 
 
 
508 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  37.35 
 
 
514 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  37.97 
 
 
496 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  35.06 
 
 
523 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2372  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  32.94 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1607  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase family protein  34.12 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0826  UxaA family hydrolase  32.94 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1078  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  32.94 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  32.94 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  34.62 
 
 
526 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  37.97 
 
 
496 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  34.48 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  34.52 
 
 
508 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  37.97 
 
 
496 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  37.97 
 
 
496 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  35.44 
 
 
496 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  37.97 
 
 
511 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  33.33 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  29.79 
 
 
509 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  34.52 
 
 
533 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  48.84 
 
 
510 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  35.42 
 
 
96 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  32.94 
 
 
509 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  33.71 
 
 
507 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  32.95 
 
 
508 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  32.91 
 
 
496 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  33.71 
 
 
523 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  32.98 
 
 
508 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  37.8 
 
 
508 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  32.94 
 
 
509 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  33.33 
 
 
550 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>