112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4882 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4882  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  520  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3882  hypothetical protein  72.36 
 
 
252 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000462301  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  29.63 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1762  hypothetical protein  28.44 
 
 
268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.438441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  32.68 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  30.08 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  29.69 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  31.73 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2035  hypothetical protein  28 
 
 
278 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  30 
 
 
272 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  29.84 
 
 
253 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  30.35 
 
 
262 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  31.3 
 
 
277 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  29.57 
 
 
278 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
271 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0067  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  29.76 
 
 
266 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  29.8 
 
 
279 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  31 
 
 
323 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  32.44 
 
 
276 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  30.74 
 
 
275 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  30.86 
 
 
275 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  29.67 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  29.88 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  29.77 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  31.4 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  26.61 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  28.63 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  30.63 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  28.4 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  28.85 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  29.72 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  29.34 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  29.06 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  34.3 
 
 
182 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  30.21 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  29.37 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  29.24 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  27.56 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  31.69 
 
 
262 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  27.62 
 
 
267 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  27.61 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  28.12 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  29.6 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  28.99 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  26.32 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  27.69 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  27.78 
 
 
277 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  29.61 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  29.36 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  28.12 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  27.35 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  27.2 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  28.45 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  32.11 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  26.81 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  27.52 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  29.83 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  29.7 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  28.4 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  29.5 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  30.68 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  28.29 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  27.17 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  28.52 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  27.53 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  27.69 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  26.46 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  30.38 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  28.93 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  27.97 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  29.43 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  27.41 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  30.36 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  29.82 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  28.16 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  28.81 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  27.56 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  27.97 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  31.43 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  27.87 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  28.63 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  27.5 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4033  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  26.07 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  27.09 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  26.83 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  26.34 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  29.73 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  26.07 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  29.55 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  26.47 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  26.14 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  25.88 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  38.38 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>