35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2623 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  85.89 
 
 
486 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  966    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  36.27 
 
 
492 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  39.35 
 
 
214 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  42.79 
 
 
215 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  40.5 
 
 
278 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  41.08 
 
 
210 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  43.01 
 
 
596 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  39.88 
 
 
215 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  39.16 
 
 
218 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  40.24 
 
 
527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  38.86 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  37.7 
 
 
309 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  37.11 
 
 
326 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  36.18 
 
 
242 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  48.39 
 
 
525 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  31.7 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  35.89 
 
 
808 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  28.33 
 
 
582 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  48.76 
 
 
471 aa  87  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  46.83 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  47.97 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  31.69 
 
 
724 aa  80.1  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  39.18 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  37.43 
 
 
631 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  37.57 
 
 
882 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  35 
 
 
509 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  34.51 
 
 
215 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  34.04 
 
 
571 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  37.19 
 
 
442 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  28.77 
 
 
771 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  28.19 
 
 
532 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 
532 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0450  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  34.71 
 
 
615 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>