24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2625 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  80.93 
 
 		 215 aa  362  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  38.57 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  40.78 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  39.88 
 
 		 485 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  36.67 
 
 		 486 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 596 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  32.48 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  30.37 
 
 		 278 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  30.39 
 
 		 527 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  30.39 
 
 		 537 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  27.94 
 
 		 399 aa  85.5  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  30.15 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  29.29 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  29.8 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 532 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 514 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 		 532 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  25.91 
 
 		 724 aa  48.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  33.66 
 
 		 771 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  31.08 
 
 		 582 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  30.43 
 
 		 571 aa  45.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>