20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2624 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  82.16 
 
 		 210 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  41.67 
 
 		 486 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  40.28 
 
 		 485 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  39.35 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  39.23 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  40.99 
 
 		 278 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  41.07 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  41.82 
 
 		 537 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  41.38 
 
 		 527 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  35.9 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  37.43 
 
 		 596 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  36.36 
 
 		 309 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  30.1 
 
 		 399 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  33.15 
 
 		 326 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  30.73 
 
 		 582 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  32.26 
 
 		 492 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  36.73 
 
 		 509 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  26.71 
 
 		 724 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  30.11 
 
 		 571 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>