20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1239 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  100 
 
 		 724 aa  1499    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  30.77 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  31.69 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  30.85 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  33.51 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  34.36 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  30.22 
 
 		 326 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  30.23 
 
 		 596 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  30.81 
 
 		 278 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  29.35 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  29.17 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  27.33 
 
 		 218 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 509 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  31.91 
 
 		 571 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  26.25 
 
 		 771 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  25.99 
 
 		 215 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  26.22 
 
 		 210 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 532 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  26.71 
 
 		 214 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  24 
 
 		 215 aa  44.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>