22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1168    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  32.34 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  42.63 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  42.55 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  41.45 
 
 		 486 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  36.51 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  34.58 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  37.56 
 
 		 242 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  41.71 
 
 		 218 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  35.09 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  39.26 
 
 		 210 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  36.27 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  36.87 
 
 		 215 aa  104  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  37.04 
 
 		 214 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  36.46 
 
 		 215 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  24.89 
 
 		 724 aa  83.2  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  30.16 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  32.6 
 
 		 582 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  28.77 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  36.11 
 
 		 514 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  33.73 
 
 		 571 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>