18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3101 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1153    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  27.94 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  25.97 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  34.86 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  32.7 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  33.11 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  31.37 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  31.22 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  29.89 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  26.34 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  28.1 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  29.21 
 
 		 596 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  26.36 
 
 		 771 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  31.08 
 
 		 215 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>