20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2619 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  78.85 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  43.56 
 
 
399 aa  202  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  43.54 
 
 
242 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  44.14 
 
 
278 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  41.94 
 
 
527 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  36.6 
 
 
537 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  37.7 
 
 
485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  37.37 
 
 
596 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  36.16 
 
 
486 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  35.83 
 
 
218 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  36.36 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  32.97 
 
 
215 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  34.66 
 
 
210 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  31.37 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  30.27 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  29.35 
 
 
724 aa  69.3  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 
509 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  35 
 
 
571 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
532 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>