35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2030 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  966    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  85.89 
 
 		 485 aa  808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  34.81 
 
 		 492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  43.17 
 
 		 214 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  42.39 
 
 		 210 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  41.45 
 
 		 596 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  38.28 
 
 		 215 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  39.76 
 
 		 278 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  37.95 
 
 		 215 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  36.78 
 
 		 218 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  37.5 
 
 		 527 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  35.2 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  34.45 
 
 		 326 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  50 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  28.64 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  33.87 
 
 		 242 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  41.49 
 
 		 808 aa  94  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  44 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  25.96 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  47.97 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  45.45 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  29.34 
 
 		 724 aa  67  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  38.24 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  31.84 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 		 615 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  32.62 
 
 		 215 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  30.93 
 
 		 571 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  33.61 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  25.45 
 
 		 771 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0450  hypothetical protein  31.45 
 
 		 167 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>