23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2037 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  80.93 
 
 		 215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  41.79 
 
 		 485 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  39.35 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  41.71 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  38.28 
 
 		 486 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  36.87 
 
 		 596 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  30.19 
 
 		 399 aa  92.8  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  30.22 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  33.12 
 
 		 278 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  30.26 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  31.52 
 
 		 537 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 527 aa  89.4  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  32.97 
 
 		 309 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  31.35 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  28.74 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  37 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  34.07 
 
 		 571 aa  52.8  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  33 
 
 		 514 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 532 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 		 532 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  25.88 
 
 		 724 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  26.47 
 
 		 582 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>