24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2379 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  46.74 
 
 
537 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  45.41 
 
 
527 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  42.53 
 
 
278 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  36.68 
 
 
486 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  39.27 
 
 
485 aa  124  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  40.98 
 
 
214 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  42.13 
 
 
596 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  38.59 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  34.83 
 
 
309 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  33.83 
 
 
326 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  29.6 
 
 
399 aa  99  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  31.47 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  35.38 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  33.99 
 
 
582 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  32.48 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  43.24 
 
 
514 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  27.33 
 
 
724 aa  62.8  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  37.7 
 
 
509 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  33.33 
 
 
492 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  53.9  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  33.96 
 
 
532 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 
532 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  27.24 
 
 
771 aa  42.4  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>