23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2621 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  75.52 
 
 
527 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
537 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  44.62 
 
 
278 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  46.74 
 
 
218 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  42.7 
 
 
242 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  42.64 
 
 
596 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  36.27 
 
 
399 aa  146  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  41.27 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  36.7 
 
 
326 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  36.07 
 
 
486 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  39.18 
 
 
485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  41.82 
 
 
214 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  39.77 
 
 
210 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  31.19 
 
 
215 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  32.67 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  32.7 
 
 
582 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  30.5 
 
 
724 aa  79  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  36.47 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 
514 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 
532 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  38.89 
 
 
509 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 
532 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  31.11 
 
 
571 aa  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>