21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2034 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  76.6 
 
 		 309 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  42.19 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  44.62 
 
 		 242 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  43.24 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  35.5 
 
 		 537 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  41.45 
 
 		 527 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  37.17 
 
 		 485 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  36.32 
 
 		 596 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  32.02 
 
 		 486 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  34.27 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  32.95 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  31.35 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  30.05 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  31.34 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  26.89 
 
 		 724 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 		 532 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 532 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 514 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>