24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3100 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  43.54 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  44.62 
 
 		 326 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  41.8 
 
 		 399 aa  161  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  39.02 
 
 		 537 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  37.66 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  41.15 
 
 		 527 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  37.56 
 
 		 596 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  36.17 
 
 		 485 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  33.82 
 
 		 486 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  33.87 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  35.16 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  30.3 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  32.72 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  34.36 
 
 		 724 aa  78.6  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  28.8 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  30 
 
 		 582 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  34.75 
 
 		 509 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 514 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1241  surface-anchored protein domain protein  25.67 
 
 		 771 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  34.38 
 
 		 571 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  30.93 
 
 		 532 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 532 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>