23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2032 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1026    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  74.9 
 
 		 537 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  32.21 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  49.46 
 
 		 278 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  45.11 
 
 		 218 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  36.15 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  41.15 
 
 		 242 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  41.94 
 
 		 309 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  41.53 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  40.24 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  41.82 
 
 		 214 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  40.35 
 
 		 210 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  32.09 
 
 		 215 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  30.39 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  29.73 
 
 		 724 aa  80.5  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  33.11 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  35.71 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  38.89 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 532 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  32.22 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>