22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2038 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  82.16 
 
 		 214 aa  320  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  41.01 
 
 		 486 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  39.35 
 
 		 485 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  40.78 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  38.6 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  38.59 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  39.53 
 
 		 596 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  39.77 
 
 		 537 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  40.35 
 
 		 527 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  34.5 
 
 		 242 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  34.66 
 
 		 309 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  28.91 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  32.61 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  29.56 
 
 		 582 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  31.87 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  33.04 
 
 		 509 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  26.22 
 
 		 724 aa  48.9  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  30.11 
 
 		 571 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 514 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  25.58 
 
 		 532 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>