22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4769 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4769  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  539  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2621  cell wall anchor domain-containing protein  44.62 
 
 		 537 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2032  cell wall anchor domain-containing protein  49.46 
 
 		 527 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.870882  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2034  hypothetical protein  42.26 
 
 		 326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.644155  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2619  hypothetical protein  44.14 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1240  surface-anchored protein domain protein  38.54 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000376372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3100  hypothetical protein  45.16 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  40.5 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2379  hypothetical protein  42.53 
 
 		 218 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.683491  normal  0.011955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4776  hypothetical protein  36.4 
 
 		 596 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0346034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  39.2 
 
 		 486 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2624  hypothetical protein  40.74 
 
 		 214 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.589978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2038  hypothetical protein  39.05 
 
 		 210 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2037  hypothetical protein  33.68 
 
 		 215 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  34.14 
 
 		 582 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2625  hypothetical protein  30.85 
 
 		 215 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1239  putative ABC transporter-associated repeat protein  28.44 
 
 		 724 aa  72.8  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000659348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  33.53 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  35.56 
 
 		 571 aa  53.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 509 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 532 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 532 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>