23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2380 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  720    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  43.41 
 
 
800 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  50.33 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0369  Htaa domain protein  44.83 
 
 
630 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  40.94 
 
 
994 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  43.03 
 
 
1127 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0072  hypothetical protein  52.94 
 
 
332 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  33.15 
 
 
1098 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  46.51 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35280  Htaa protein  33.18 
 
 
1212 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  41.25 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  38.51 
 
 
882 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  38.67 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  36.42 
 
 
215 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  37.01 
 
 
631 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  40.5 
 
 
471 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  33.54 
 
 
808 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  31.62 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2877  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.32 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.651408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  37.95 
 
 
485 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  36.65 
 
 
486 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2670  hypothetical protein  28.65 
 
 
166 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  34.15 
 
 
615 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>