16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3874 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  910    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3875  hypothetical protein  51.53 
 
 
426 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  0.0255887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2763  hypothetical protein  45.99 
 
 
456 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  41.78 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  58.64 
 
 
543 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  47.5 
 
 
808 aa  100  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  42.19 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  39.53 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  46.43 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  36.69 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  40.5 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  34.87 
 
 
882 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  35.76 
 
 
615 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  34.15 
 
 
215 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  37.8 
 
 
486 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  27.22 
 
 
631 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>