More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2387 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2342  L-serine ammonia-lyase  99.78 
 
 		 455 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.966774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2545  L-serine ammonia-lyase  99.56 
 
 		 477 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.128617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2387  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 455 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.288387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2435  L-serine ammonia-lyase  99.56 
 
 		 455 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2431  L-serine ammonia-lyase  99.78 
 
 		 455 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.386335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  53.11 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  51.22 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  52.1 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  49.46 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  49.89 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  48.92 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  49.45 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  49.67 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  49.12 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  49.46 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  51.11 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  49.23 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  49.23 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  51.11 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  49.46 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  49.45 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  50.22 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  51.11 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  50.56 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  49.23 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  49.01 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  50.88 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  49.44 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  47.72 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  48.79 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  48.79 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  50.44 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  49.34 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  50.44 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  50.56 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  50.44 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  50.22 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  50.11 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  50.11 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  50.11 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  48.79 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  48.37 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  50.11 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  48.24 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  47.69 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  51.56 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  47.7 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3114  L-serine ammonia-lyase  48.03 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.6475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  48.03 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  46.61 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  48.03 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  48.03 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3294  L-serine ammonia-lyase  48.03 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  49 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  48.66 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  47.12 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  48.46 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  47.26 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  46.83 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  46.17 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  46.46 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  45.8 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  46.02 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  46.02 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  45.8 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  45.97 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  46.02 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  46.02 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  44.93 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  48.66 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  49.01 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  47.77 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  45.77 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  46.24 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  48.01 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  47.99 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  46.9 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  47.76 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  46.53 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  46.97 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>