More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0772 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  75.77 
 
 		 455 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  78.41 
 
 		 455 aa  751    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  69.01 
 
 		 453 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  67.63 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  67.85 
 
 		 454 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  67.18 
 
 		 461 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  67.63 
 
 		 454 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  68.07 
 
 		 454 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  67.41 
 
 		 454 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  69.23 
 
 		 453 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  67.85 
 
 		 454 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  67.63 
 
 		 454 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  67.85 
 
 		 454 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  68.29 
 
 		 454 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  68.35 
 
 		 453 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  67.41 
 
 		 454 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  69.82 
 
 		 464 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 455 aa  939    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  69.23 
 
 		 453 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  67.85 
 
 		 454 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  76.43 
 
 		 455 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  66.52 
 
 		 454 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  65.85 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  65.33 
 
 		 453 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  64.52 
 
 		 454 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  65.63 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  64.24 
 
 		 455 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  64.69 
 
 		 454 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  64.24 
 
 		 455 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  64.24 
 
 		 455 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  64.24 
 
 		 455 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  64.69 
 
 		 454 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  64.24 
 
 		 455 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.69 
 
 		 456 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.69 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  64.24 
 
 		 455 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  64.69 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  64.24 
 
 		 455 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  64.24 
 
 		 455 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  64.69 
 
 		 454 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  64.69 
 
 		 454 aa  607  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  64.47 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  64.02 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  65.49 
 
 		 456 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  63.58 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.85 
 
 		 456 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  63.38 
 
 		 454 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  63.38 
 
 		 454 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  63.16 
 
 		 454 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  62.75 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  63.16 
 
 		 454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  62.72 
 
 		 454 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  63.58 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  64.68 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3114  L-serine ammonia-lyase  63.58 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.6475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3294  L-serine ammonia-lyase  63.58 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  63.58 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  63.5 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  63.58 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  56.04 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  55.6 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  55.6 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  55.6 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  55.82 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  55.82 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  53.93 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  55.82 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  55.16 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  55.04 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  54.51 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  54.73 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  54.41 
 
 		 468 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  54.05 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  54.41 
 
 		 460 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  53.44 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  53.66 
 
 		 476 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  52.76 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  53.52 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  53.13 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  51.42 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  54.08 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  52.4 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  54.29 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  53.42 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  52.65 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  51.21 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  50.85 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>