More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0864 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  66.23 
 
 		 455 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  67.63 
 
 		 454 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  67.91 
 
 		 453 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  69.18 
 
 		 454 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  88.35 
 
 		 455 aa  848    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  68.74 
 
 		 454 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  66.96 
 
 		 454 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  69.62 
 
 		 454 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  76.43 
 
 		 455 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  69.18 
 
 		 454 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 455 aa  942    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  69.4 
 
 		 454 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  68.79 
 
 		 453 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  69.84 
 
 		 454 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  69.18 
 
 		 454 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  69.18 
 
 		 454 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  69.89 
 
 		 453 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  68.74 
 
 		 461 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  78.02 
 
 		 455 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  69.4 
 
 		 454 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  68.5 
 
 		 464 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  69.84 
 
 		 454 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  68.57 
 
 		 453 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  69.4 
 
 		 454 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  66.23 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  66.23 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  66.23 
 
 		 455 aa  631  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  66.23 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  66 
 
 		 455 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  66.23 
 
 		 455 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  66.59 
 
 		 454 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  66.23 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  66 
 
 		 455 aa  631  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  65.41 
 
 		 453 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  66.74 
 
 		 453 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  66.23 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  67.48 
 
 		 456 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  66.59 
 
 		 455 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  66.89 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  66.89 
 
 		 455 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3114  L-serine ammonia-lyase  66.89 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.6475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3294  L-serine ammonia-lyase  66.89 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  66.89 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  66.23 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  65.19 
 
 		 454 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  65.19 
 
 		 454 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  66.45 
 
 		 455 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  64.97 
 
 		 454 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  64.97 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  64.75 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  65.04 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  65.04 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  64.82 
 
 		 454 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.82 
 
 		 456 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  55.02 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  55.14 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  54.61 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  54.61 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  54.61 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  54.39 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  54.39 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  53.95 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  56.56 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  54.17 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  53.19 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  54.17 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  53.95 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  54.17 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  53.93 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  54.17 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  52.31 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  53.29 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  54.1 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  52.75 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  53.74 
 
 		 468 aa  481  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  53.07 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  54.77 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  54.75 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  55.09 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  53.2 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  54.53 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  54.85 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  53.08 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  53.17 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  52.98 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  53.74 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  51.28 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  52.84 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>