More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0608 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  81.36 
 
 		 456 aa  790    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  81.8 
 
 		 458 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  79.39 
 
 		 456 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  80.92 
 
 		 456 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 476 aa  987    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  71.05 
 
 		 456 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  58.63 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  58.85 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  56.98 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  55.97 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  55.75 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  55.56 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  56.1 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  55.53 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  55.88 
 
 		 454 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  55.88 
 
 		 454 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  55.53 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  55.21 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  55.21 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  55.88 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  55.21 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  55.95 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  55.75 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  55.95 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  55.75 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  55.95 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  55.95 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  55.75 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  55.75 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  54.39 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  55.95 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  55.43 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  54.77 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  55.88 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  54.55 
 
 		 455 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  55.21 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  55.09 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  55.43 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  55.21 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  55.21 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  55.21 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  55.21 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  55.21 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  55.21 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  55.21 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  54.99 
 
 		 454 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  54.55 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  52.99 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  55.21 
 
 		 453 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  54.32 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  54.65 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  54.87 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  54.87 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3114  L-serine ammonia-lyase  54.87 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.6475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3294  L-serine ammonia-lyase  54.87 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  54.87 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  56.43 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  53.86 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  54.1 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  53.66 
 
 		 455 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  54.77 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  54.08 
 
 		 455 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  52.48 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  52.41 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  54.14 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  53.17 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  51.86 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  51.65 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  50.52 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  49.89 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  53.3 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  53.44 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  52.76 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  52.99 
 
 		 458 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  52.19 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  52.43 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  51.43 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  49.78 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  50.22 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  52.31 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  51.5 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  52.99 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  50.66 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  50.33 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  50 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  50 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  50.33 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  52.77 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  52.09 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>