More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3617 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 458 aa  944    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  67.54 
 
 		 457 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  66.59 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  65.73 
 
 		 458 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  65.73 
 
 		 458 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  65 
 
 		 458 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  65.65 
 
 		 458 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  65.43 
 
 		 458 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  65.73 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  65.22 
 
 		 458 aa  611  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  65.73 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  65.73 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  65.73 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  65.73 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  64.86 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  65.08 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  65.22 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  64.64 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  64.43 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  60.22 
 
 		 457 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  58.44 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  58.66 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  58.79 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  58.87 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  58.58 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  58.87 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  58.79 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  57.61 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  57.21 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  58.19 
 
 		 460 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  58.39 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  56.55 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  56.99 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  56.99 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  56.99 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  57.42 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  56.96 
 
 		 455 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  55.8 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  56.33 
 
 		 454 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  56.33 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  56.09 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  58.7 
 
 		 473 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  58.57 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  57.66 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  56.33 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  57.67 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  56.69 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  58.41 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  56.11 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  56.11 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  58.13 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  56.21 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  56.55 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  56.11 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 		 455 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  56.77 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  56.75 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  57.97 
 
 		 461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  56.21 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  56.21 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  57.82 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  57.76 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  56.62 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  55.99 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  57.6 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  56.43 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  56.83 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  54.9 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  58.13 
 
 		 458 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  58.44 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  57.76 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  57.76 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  57.11 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  57.11 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  56.96 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  57.76 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  57.92 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  54.23 
 
 		 455 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  55.12 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  54.45 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  58.13 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  55.12 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  55.12 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  55.12 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  55.12 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  53.93 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  57.05 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  54.23 
 
 		 455 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  57.7 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  55.12 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  55.12 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  54.23 
 
 		 455 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>