More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0712 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0712  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0250089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11240  phosphoheptose isomerase  64.04 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.184865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2640  phosphoheptose isomerase  60.56 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  63.01 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0460  sugar isomerase (SIS)  61.54 
 
 		 226 aa  205  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1749  phosphoheptose isomerase  59.55 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0570  sugar isomerase (SIS)  57.38 
 
 		 234 aa  195  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  55.56 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0356  phosphoheptose isomerase  58.47 
 
 		 241 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  47.85 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  48.98 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  46.1 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  44.51 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  52.45 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  44.91 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  48.98 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  48.33 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  48.5 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  47.92 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  46.1 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  47.77 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  43.71 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  47.77 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  46.71 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  48.21 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  44.75 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  52.56 
 
 		 358 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  44.62 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  52.56 
 
 		 358 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 		 280 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  48.34 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  46.94 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  47.1 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  41.11 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  48.34 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  53.15 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  41.49 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  43.23 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  43.64 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  50.67 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  49.35 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  44.81 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  42.51 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  43.42 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  45.21 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  43.56 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  43.56 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  48.98 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  43.83 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  42.94 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  49.33 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  43.56 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  41.81 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  44.31 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  42.33 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  47.95 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  45.39 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  47.95 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  44.1 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  45.39 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  44.22 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  44.22 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  47.37 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  38.83 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  44.03 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  47.37 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  46.21 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  43.4 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>