More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3557 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65674  normal  0.797178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7074  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 		 697 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.663612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  38.69 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.8 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  30.64 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3553  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.07 
 
 		 699 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.68 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.75 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1746  enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 		 699 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0570089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  34.64 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3068  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.2 
 
 		 677 aa  99  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.412331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4238  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.37 
 
 		 699 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.87479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0828  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.42 
 
 		 678 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5110  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  38.98 
 
 		 715 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0890426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.89 
 
 		 695 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1949  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.31 
 
 		 692 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1010  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.01 
 
 		 509 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  37.91 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 275 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2226  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.22 
 
 		 697 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0438642  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.53 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  36.81 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  36.81 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0322  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 748 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1447  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.73 
 
 		 693 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16655  hitchhiker  0.00919085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.89 
 
 		 692 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.28 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1488  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.73 
 
 		 693 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00162023  normal  0.0186497 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 		 257 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 		 266 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1405  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  34.57 
 
 		 693 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.86075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0915  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.08 
 
 		 686 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2274  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  37.71 
 
 		 694 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538462  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1855  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 		 693 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202152  normal  0.373323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>