More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6159 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  76.83 
 
 		 268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  48 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.34 
 
 		 651 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.35 
 
 		 661 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.97 
 
 		 662 aa  148  9e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.59 
 
 		 662 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.2 
 
 		 662 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.51 
 
 		 663 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.13 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.14 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.22 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.72 
 
 		 659 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 		 259 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.82 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.82 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>