More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2604 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  86.69 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.42 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.4 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.02 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.07 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.78 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  64.85 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  60.26 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  59.91 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  60.34 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  47.72 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.09 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.93 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.03 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.03 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  33.03 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  33.03 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  33.03 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 		 797 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  37.68 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.11 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  31.19 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  32.11 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  31.65 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  31.67 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.39 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.41 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.95 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.44 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.88 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  33.51 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.17 
 
 		 657 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.75 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.32 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  36.24 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.68 
 
 		 663 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1841  short chain enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 		 150 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>