More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3981 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.09 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  75.81 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  75.81 
 
 		 252 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  75.81 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  76.21 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  75.82 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  75.81 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  71.71 
 
 		 252 aa  338  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.66 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.66 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.96 
 
 		 255 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  70.56 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  62.07 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  60.94 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  45.61 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  44.26 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.12 
 
 		 214 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  35.87 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  34.08 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  32.27 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  32.24 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  32.24 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.82 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.82 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  31.78 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.39 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  31.39 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  31.78 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  31.78 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  31.82 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.96 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.02 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.02 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  27.73 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.19 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.06 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  30.16 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.19 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.82 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.71 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>