More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3427 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3692  carbohydrate kinase, PfkB/ribokinase  99.66 
 
 		 292 aa  567  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3427  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  50.67 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  49.32 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  32.78 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  32.78 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  35.27 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  32.78 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  33.11 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.12 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  32.01 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  32.68 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  36.72 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  32.68 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.39 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  32.12 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  32.45 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  29.41 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.34 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  29.41 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  32.14 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  31.79 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.44 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.67 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.22 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  30.17 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.77 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  32.11 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.43 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  33.89 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  31.63 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.1 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  31.89 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  32.01 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  34.21 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  31.89 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  31.13 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  32.88 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  31.89 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  32.42 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  27.85 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.38 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.79 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  32.12 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  28.38 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  31.56 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.57 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  27.1 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.89 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  32.89 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  25.57 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  29.9 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.76 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.19 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  30.59 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  27.81 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25.17 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  34.54 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  30.23 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  30.23 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  30.23 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  33.82 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  31.62 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  33.06 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  30.55 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  30.21 
 
 		 424 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.19 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.19 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  30.46 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  30.46 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  30.56 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  30.43 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  29.87 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.21 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.71 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  29.87 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.09 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  27.57 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  30.13 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  30.46 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  27.15 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  24.51 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  32.65 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  30.64 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.89 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  30.26 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>