More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2200 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
132 aa  262  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  96.21 
 
 
132 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  95.45 
 
 
132 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  59.38 
 
 
131 aa  140  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.2 
 
 
137 aa  134  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  59 
 
 
132 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.29 
 
 
148 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.46 
 
 
134 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.51 
 
 
135 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.51 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.06 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.98 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.83 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.49 
 
 
132 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.31 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.17 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.17 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.59 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.98 
 
 
138 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.2 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.72 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  46.15 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.7 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.4 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.25 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.7 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.53 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.25 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.67 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.08 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.46 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.35 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.27 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.96 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3844  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.08 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.78 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.02 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.93 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  37.04 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.76 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  31.09 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.67 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.02 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.86 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.47 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.48 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.75 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.97 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.18 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.62 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.97 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.11 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.97 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.18 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.18 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.11 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>