More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0217 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
134 aa  266  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.97 
 
 
133 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.37 
 
 
135 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.37 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.86 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.09 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.61 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
151 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.36 
 
 
139 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.61 
 
 
135 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.8 
 
 
133 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.11 
 
 
139 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
135 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.57 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.69 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.69 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.4 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.81 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.1 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
135 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.18 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.06 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.87 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.88 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
136 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.38 
 
 
87 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.74 
 
 
133 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.44 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.25 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.59 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  34.33 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.33 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.84 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  44.33 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.57 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.59 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.61 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.89 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.06 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.58 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.05 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.66 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.13 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.23 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.01 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.01 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.29 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.1 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.89 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.52 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.31 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.33 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.89 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  42.17 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.05 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.96 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.45 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>