More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1466 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.8 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.84 
 
 
139 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.24 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.83 
 
 
135 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.03 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.66 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.62 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.09 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.83 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.4 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.27 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.27 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.72 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.4 
 
 
135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.31 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.94 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  54.37 
 
 
134 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.09 
 
 
135 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.35 
 
 
133 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
135 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
133 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
133 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
133 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.64 
 
 
138 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.19 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.63 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.49 
 
 
87 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.49 
 
 
132 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.04 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.33 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.96 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  43.86 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.09 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.75 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.05 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
137 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.83 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.45 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.38 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.58 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.05 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.35 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.98 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.23 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.53 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.35 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  31.75 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.68 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.31 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.75 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.43 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.96 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.14 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.58 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.89 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>