More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2082 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
139 aa  277  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.79 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.84 
 
 
132 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.59 
 
 
133 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.43 
 
 
135 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.54 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.64 
 
 
138 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.64 
 
 
135 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.65 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
134 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.98 
 
 
135 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.57 
 
 
135 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.98 
 
 
135 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.36 
 
 
134 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.9 
 
 
151 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
135 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
135 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.81 
 
 
135 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
135 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.22 
 
 
139 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.69 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.55 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.35 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.63 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.59 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.31 
 
 
132 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  45.71 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.55 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  46.53 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.44 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.76 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.9 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.45 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.48 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.95 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.4 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.79 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.53 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.44 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.67 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.88 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.07 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.59 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.7 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.57 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.57 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.71 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.57 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  35 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.68 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.67 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.57 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.61 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.4 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.43 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.81 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.59 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.54 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  36.29 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  35 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.61 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.54 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.83 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3844  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.61 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.83 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.29 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.52 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.61 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.83 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>