More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0624 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
87 aa  173  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  67.9 
 
 
85 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  67.5 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.47 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  59.49 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  58.75 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.47 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.65 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  56.47 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.87 
 
 
86 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.38 
 
 
134 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.76 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.12 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.76 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.12 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.94 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.57 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.76 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.41 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.81 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.81 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.44 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.81 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.43 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.62 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.56 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.56 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.38 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  41.67 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.24 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.34 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.25 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.68 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.04 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.24 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.71 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.53 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.48 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.93 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  45.68 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.17 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.35 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.82 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.35 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.48 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.53 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.7 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.82 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.14 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.48 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0381  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.1 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.7 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.17 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.29 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2128  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.1 
 
 
130 aa  59.3  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000357189  hitchhiker  0.00501726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.29 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.74 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.1 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.52 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.02 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.47 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.98 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.1 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.63 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.1 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.63 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  40.51 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  31.17 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.26 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1800  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.35 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502028  normal  0.0883001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.71 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.73 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.86 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.48 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>